Na série Naruto, treinando no Monte Myouboku, sob a supervisão do Sábio dos Sapos, Naruto aprendeu uma nova habilidade: o Modo Sennin. O Monte Myouboku é um local muito importante no desenvolvimento do Naruto durante toda a série. Foi também no Monte Myouboku que foi revelada interpretação da Criança da Profecia. Seja o Jiraiya ou o Gamabunta, o Gamakichi ou o Senhor Fukasaku, todos estão ligados ao Monte Myouboku. A Batalha dos Sábios de Naruto Online é um novo modo de jogo PVP multi-jogador que tem como fundo a história dos três mestres sennin.

Sendo um dos principais modos de jogo de Naruto Online, a Batalha dos Sábios é ativada três vezes por semana: às terças-feiras, às quintas-feiras e aos domingos. A Batalha é realizada das 19:30 às 20:05. Todos os jogadores estão qualificados para participar a partir do nível 30.Quando o evento começa, aparece um ícone no canto superior esquerdo. Clicando neste ícone pode entrar na tela do evento para se inscrever.

Quando as inscrições terminam ainda é preciso esperar 10 minutos para entrar no campo de batalha. Enquanto espera pode ler as regras da batalha e ver os prêmios que pode ganhar, assim como verificar que tem o equipamento indicado para a batalha. Quando o campo de batalha é aberto, o sistema distribui todos os jogadores por três facções com o mesmo número de jogadores. As três facções são chamadas Monte Myouboku, Caverna Ryuchi e Floresta Shikkotsu. Os jogadores lutam com jogadores de outras fações. O sistema de combate adotado é PVP 1 vs. 1. O ranking é formado por um sistema de pontuação. Se vencer, tanto o jogador como a facção a que pertence receberão muitos pontos.

Cada jogador tem um determinado número de pontos de moral. O valor inicial, que é também o valor máximo, é 100 pontos de moral. Quando perde um combate, o número de pontos é reduzido; quando ganha um combate, o número de pontos é aumentado. Quando o valor atinge os 0 pontos, o jogador é expulso do campo de batalha, não podendo voltar a combater. Quando uma fação elimina todos os jogadores das fações adversárias do campo de batalha ou quando é atingido o tempo de limite da batalha, a fação com o maior número de pontos é a facção vencedora. A Batalha dos Sábios pode acomodar mais de cem jogadores jogando ao mesmo tempo, sendo um grande teste para os conhecimentos de jutsus de cada jogador. Quanto a como ganhar, é preciso que cada membro da facção mantenha a cabeça fria e coordene o seu ataque de forma racional, de forma a utilizar toda a sua habilidade de combate.

A posição no ranking é definida pelo valor da pontuação. Esta posição é utilizada para decidir a facção vencedora e os jogadores de destaque (os melhores três jogadores de cada facção). A pontuação obtida está diretamente relacionada com os prêmios que pode obter: quantos mais pontos obtiver, mais prêmios pode obter. Então, como se pode obter uma pontuação mais alta? Uma forma importante de obter uma pontuação alta é conseguindo vitórias consecutivas. A partir de três vitórias consecutivas receberá cada vez mais pontos; a sua vitória será também anunciada com uma mensagem na tela principal, por isso, você se torna um alvo para os membros das outras facções. Da mesma forma, se você conseguir derrotar um jogador com mais mais de três vitórias consecutivas de outra facção também obtém uma grande quantidade de pontos.

Quando a batalha termina, todos os jogadores recebem prêmios correspondentes ao seu desempenho. Adicionalmente, a melhor facção e os jogadores mais excepcionais também receberão o prêmio de facção vencedora e de jogador destaque, respetivamente. Estes prêmios ajudam todos os jogadores a obter mais rapidamente os ninjas e os itens que precisam. Ficará ainda mais forte nos combates!